Me ha
parecido interesante introducir dos importantes fuentes de información sobre
Cancer y tratamiento: CanSAR y Cancer Therapeutic Regimens 2017.
CanSAR (https://cansar.icr.ac.uk/). Su
nombre refleja
el hecho de integrar datos relacionados con cáncer con datos compuestos de
Estructura-Actividad-Relación (SAR).
CanSAR es una base de
conocimientos integrada que reúne datos multidisciplinarios a través de la biología,
química, farmacología, biología estructural, redes celulares y anotaciones
clínicas, y aplica enfoques de aprendizaje automático para proporcionar
predicciones útiles para el descubrimiento de fármacos.
Su objetivo es integrar
estos datos y hacerlos accesibles a los científicos que investigan en cáncer de
múltiples disciplinas, para ayudar a la generación de hipótesis y la toma de
decisiones hacia la identificación de causas, biomarcadores y terapéuticas para
el cáncer.
Proporciona
un portal de información único para responder a preguntas multidisciplinarias
complejas incluyendo - entre muchas otras: ¿Qué se sabe acerca de una proteína,
en qué tipo de cáncer se expresa o muta y qué herramientas químicas y modelos
de líneas celulares pueden usarse para probar experimentalmente su actividad?
¿Qué se sabe acerca de un fármaco, su perfil de sensibilidad celular y a qué
proteínas se sabe que se unen que puedan explicar una bioactividad inusual?
CanSAR esta financiado por
una beca del Cancer Research UK. CanSAR está disponible gratuitamente para
todos los investigadores del cáncer, tanto académico como comercial.
Tratan de tener una
actualización de datos y de funcionalidades menores cada mes. Sin embargo, la
mayoría de los datos en canSAR proceden de fuentes públicas que tienen
diferentes ciclos de actualización. Los orígenes de los datos (Data Sources) permiten ver el estado de
cada actualización.
Tiene muchas posibilidades, solo he probado las mas sencillas. Si en la
página principal pinchamos “About”, en la parte superior veremos
Genes and Proteins | Diseases | Protein
Families | 3D Structures | Cell Lines | Compounds
| Tools | Browse
Si
pinchamos Diseases presenta 37
enfermedades.
Seleccionamos Bowel Cancer, que incluye Cáncer Colorectal.
Bowel Cancer - Overview
- Disease Synopsis;
Esta página sumariza los medicamentos relevantes y
candidatos en ensayo clínico, los ensayos clínicos, modelos de líneas celulares,
compuestos analizados para esta enfermedad, y mapeos (mappings)
Drugs & Clinical Candidates; Clinical Trials;
Cell Line
Models; Chemistry; Mappings
Al
hacer clic en "Drugs & Clinical Candidates" se muestra una
tabla clasificable de todos los compuestos utilizados (o en ensayos clínicos) para
tratar esta enfermedad.
17 drugs have received FDA approval for Bowel Cancer. Trifluridine and
Tipiracil Hydrochloride, Ramucirumab, Recombinant Human Papillomavirus
(HPV) Quadrivalent Vaccine, Bevacizumab, Oxaliplatin, Ziv-Aflibercept,
Capecitabine, Panitumumab, Imatinib Mesylate, Sunitinib Malate,
Recombinant Human Papillomavirus (HPV) Nonavalent Vaccine, Leucovorin Calcium,
Everolimus, Irinotecan Hydrochloride, Cetuximab, Regorafenib and
Fluorouracil Injection
344 drugs have a clinical trial registered for Bowel
Cancer.
Sources: cancer.gov and clinicaltrials.gov
(subrayamos los utilizados en cáncer colorrectal
como inmunoterapia)
Falta
entre los aprobados por FDA
Pembrolizumab (Keytruda, Merck Sharp & Dohme), aprobación terapia innovadora por FDA (2/11/2015)
para cáncer colorrectal metastásico con alta inestabilidad de microsatélites
(MSI-H); aprobación
acelerada por FDA 23/05/2017 para cáncer
colorrectal metastásico con alta inestabilidad de microsatélites (MSI-H) o deficiente
reparación de desemparejamientos (dMMR) después de progresión con
fluoropirimidina, oxaliplatino e irinotecán.
Si en Diseases seleccionamos
Ovarian cancer (Cancer
de Ovario)
Al hacer clic en “Drugs & Clinical Candidates”.
12 drugs have received FDA approval for Ovarian Cancer. Cisplatin, Olaparib,
Topotecan Hydrochloride, Cyclophosphamide, Carboplatin, Doxorubicin
Hydrochloride Liposome, Bevacizumab, Gemcitabine Hydrochloride,
Melphalan, Thiotepa, Doxorubicin Hydrochloride and Paclitaxel.
259 drugs have a clinical trial registered for Ovarian
Cancer.
Sources: cancer.gov and clinicaltrials.gov
(subrayamos los utilizados en cáncer de ovario como
inmunoterapia)
Faltan
entre los aprobados por FDA
Rucaparib (Rubraca, Clovis Oncology, Inc.), aprobación acelerada por FDA el 19/12/2016
Niraparib (Zejula,
Tesaro Inc) aprobado por la FDA
el
27/3/2017; No aprobado en EMA
He querido comprobar el grado de coincidencia de los medicamentos
en ensayos clínicos identificados en mi Blog y los identificados en la base canSAR
(259) para Cáncer de ovario. Como son muchos en la base y no están por orden
alfabético he tenido que limitarlos a los Anticuerpos Monoclonales que son los más
fáciles de identificar.
Blog*-
Anticuerpos Monoclonales identificados en ensayos clínicos en Blog: Anti-TA-MUC1, Avelumab, Catumaxomab, Demcizumab, Durvalumab, Durvalumab/
motolimod/ quimioterapia, Durvalumab y Tremelimumab, Farletuzumab, Mirvetuximab soravtansina, Pembrolizumab
*Blog 5/8/2017 “Cáncer de ovario y los medicamentos
que se utilizan, 3”
canSAR - Anticuerpos Monoclonales:
Atezolizumab, Cetuximab, Ipilimumab, Nivolumab, Panitumumab, Pertuzumab,
Trastuzumab, Tremelimumab
Solo han coincidido con el Tremelimumab
Joseph E. Tym, Costas Mitsopoulos, Elizabeth A. Coker, Parisa Razaz,
Amanda C. Schierz, Albert A. Antolin, and Bissan Al-Lazikani. canSAR: an
updated cancer research and drug discovery knowledgebase. Nucleic Acids
Res. 2016 Jan 4;44(D1):D938-43. doi: 10.1093/nar/gkv1030. Epub 2015 Dec 15.
Cancer
Therapeutic Regimens 2017. Adams VR, DeRemer D,
Bernhardt MB. (http://www.clinicaloncology.com/EssentialOncology/regimens)
Esta
aplicación (app) está diseñada para ser un resumen de los regímenes
terapéuticos contra el cáncer y aunque es detallada, no es una revisión exhaustiva.
Esta aplicación enumera
algunos de los regímenes de combinación comunes y las dosis utilizadas en los
cánceres observados. También enumera los regímenes seleccionados de un solo
agente. Los regímenes y dosis incluidos se seleccionaron sobre la base de los
siguientes criterios:
-
regímenes publicados en los compendios de reembolso;
-
regímenes evaluados positivamente en las principales revistas en inglés;
-
regímenes / agentes que han recibido aprobación de la FDA con o sin literatura
publicada;
-
o regímenes publicados en 2 referencias terciarias.
La exactitud de todos los
regímenes en esta aplicación ha sido contrastada con los encontrados en la
literatura científica. Por lo tanto, en cada caso, se proporcionan las referencias.
Los
apartados que comprende son:
Introduction;
Emetogenic Potential; Solid Tumors (Adult); Hematologic Malignancies (Adult); Pediatric
Cancer Therapeutic Regimens; Index of Drugs; Key; Footnotes to Regimens; Search
Si seleccionamos Solid Tumors
(Adult) >> Cáncer colorrectal (Colorectal Cancer), vemos los apartados:
Epidemiology and Risk Factors; Pathogenesis: Genetics and Epigenetics;
Diagnosis; Treatment; Clinical Trials on Stage IV Colorectal Cancer;
References; Key; Search.
Si seleccionamos “Treatment”
tiene los siguientes apartados:
Surgery; Neoadjuvant Chemoradiation; Adjuvant Chemotherapy; Stage II
Controversy in Colon Cancer; Role of Oncotype DX in Predicting Colon Cancer
Recurrence; Evolution of Stage III Therapy; Treatment of Metastatic Disease; Resectable
Metastatic Disease; Treatment options for metastatic CRC; First-Line Therapy; Second-Line
Therapy; Third-Line Therapy
En Indice de medicamentos (Index
of Drugs), se pueden contar 159 medicamentos, de los cuales: 72 son inmunologicos;
y 87 quimioterapicos. Figura el nombre genérico y el nombre comercial.
En
Buscar (Search), introduzco Olaparib, este es el resultado:
Gynecologic Malignancy—Ovarian/Epithelial
Olaparib Single-Agent
Regimen
Schedule: Olaparib 400 mg PO bid, daily until disease progression
Emetogenic Potential: Moderate-High
Reference: Kaufman B, Shapira-Frommer R, Schmutzler RK, et al. Olaparib
monotherapy in patients with advanced cancer and a germline BRCA1/2 mutation. J Clin Oncol. 2015;33(3):244-250.
The Guide to Cancer Therapeutic Regimens 2017 está ahora
disponible como guía de bolsillo (Pocket Guide). McMahon
Publishing Group
